RNA-seq

定义 Definition

RNA-seq（RNA sequencing，RNA测序/转录组测序）是一种通过高通量测序技术读取细胞或组织中RNA（通常转换为cDNA）序列的方法，用于分析基因表达水平、发现新转录本、剪接变体以及融合基因等。

例句 Examples

We used RNA-seq to compare gene expression in treated and untreated cells.
我们使用RNA-seq来比较处理组与未处理组细胞的基因表达差异。

RNA-seq revealed alternative splicing events and previously unannotated transcripts in the developing brain.
RNA-seq在发育中的大脑样本中揭示了可变剪接事件以及先前未被注释的新转录本。

发音 Pronunciation (IPA)

/ˌɑːr.ɛnˈeɪ sɛk/

词源 Etymology

RNA-seq是“RNA（ribonucleic acid，核糖核酸）”与“seq（sequencing，测序）”的缩略组合写法，流行于2000年代后期高通量测序普及之后，用来指代“基于测序的RNA分析”。在学术写作中也常写作“RNA-Seq”或直接写作“RNA sequencing”。

相关词 Related Words

• Transcriptome
• Sequencing
• Gene
• Expression
• Read
• Alignment
• Annotation
• Splicing
• Differential

文学与著名作品 Notable Works

• Mortazavi et al. (2008), Nature Methods: “Mapping and quantifying mammalian transcriptomes by RNA-Seq”——早期奠基性论文之一，系统展示RNA-seq用于转录组定量。
• Wang, Gerstein & Snyder (2009), Nature Reviews Genetics: “RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics”——经典综述文章，推动“RNA-seq”术语与方法的广泛传播。
• Conesa et al. (2016), Genome Biology: “A survey of best practices for RNA-seq data analysis”——常被引用的分析实践指南，文中大量使用RNA-seq。
• Current Protocols in Molecular Biology（多篇实验流程章节）——在标准实验方法汇编中，RNA-seq作为常规转录组技术被频繁提及。